The data originate from the "NAIADES" database. Available endpoints are:
get_hydrobio_stations_hydrobio retrieves site data and locations
get_hydrobio_indices retrieves bioassessment indices values
get_hydrobio_taxons retrieves taxa data
See the API documentation for available filter parameters: https://hubeau.eaufrance.fr/page/api-hydrobiologie
get_hydrobio_stations_hydrobio(...)
get_hydrobio_indices(...)
get_hydrobio_taxons(...)parameters of the queries and their values in the format
Param1_Name = "Param1 value", Param2_Name = "Param2 value", use the
function list_params for a list of the available filter parameters
for a given API endpoint and see the API documentation for their description
A tibble::tibble with one row by record and one column by field.
# \dontrun{
# Retrieve the hydrobiology monitoring sites in the Pays-de-Loire region
list_params(api = "hydrobio",
endpoint = "stations_hydrobio")
#> [1] "bbox" "code_bassin"
#> [3] "code_commune" "code_cours_eau"
#> [5] "code_departement" "code_masse_eau"
#> [7] "code_region" "code_sous_bassin"
#> [9] "code_station_hydrobio" "codes_appel_taxons"
#> [11] "codes_indices" "codes_reseaux"
#> [13] "codes_supports" "date_service"
#> [15] "distance" "fields"
#> [17] "format" "latitude"
#> [19] "libelle_station_hydrobio" "longitude"
#> [21] "page" "size"
#> [23] "sort"
get_hydrobio_stations_hydrobio(code_region = 52)
#> # A tibble: 1,015 × 1,875
#> code_station_hydrobio libelle_station_hydrobio uri_station_hydrobio
#> <chr> <chr> <chr>
#> 1 03271654 LA CHEVAUCHERIE A MONTAUDIN 1 https://id.eaufranc…
#> 2 03271657 LE RUISSEAU DE LA MORINIÈRE A SAI… https://id.eaufranc…
#> 3 03271661 LA HOGUE A SAINT-BERTHEVIN-LA-TAN… https://id.eaufranc…
#> 4 03271679 LA FUTAIE A SAINT-ELLIER-DU-MAINE… https://id.eaufranc…
#> 5 03271699 LA FUTAIE A PONTMAIN 2 https://id.eaufranc…
#> 6 03271710 LA FUTAIE A PONTMAIN 3 https://id.eaufranc…
#> 7 03271730 LA GLAINE A LA BAZOUGE-DU-DESERT 2 https://id.eaufranc…
#> 8 03271850 L'AIRON A LANDIVY 1 https://id.eaufranc…
#> 9 04098400 LOIRE à MONTSOREAU https://id.eaufranc…
#> 10 04102000 THOUET à MONTREUIL-BELLAY https://id.eaufranc…
#> # ℹ 1,005 more rows
#> # ℹ 1,872 more variables: coordonnee_x <dbl>, coordonnee_y <dbl>,
#> # code_projection <chr>, code_cours_eau <chr>, libelle_cours_eau <chr>,
#> # uri_cours_eau <chr>, code_masse_eau <chr>, libelle_masse_eau <chr>,
#> # uri_masse_eau <chr>, code_sous_bassin <chr>, libelle_sous_bassin <chr>,
#> # code_bassin <chr>, libelle_bassin <chr>, code_commune <chr>,
#> # libelle_commune <chr>, code_departement <chr>, libelle_departement <chr>, …
# Retrieve the hydrobiological bioassessment indices in the city of Rennes
list_params(api = "hydrobio",
endpoint = "indices")
#> [1] "bbox" "code_banque_reference"
#> [3] "code_bassin" "code_commune"
#> [5] "code_cours_eau" "code_departement"
#> [7] "code_indice" "code_masse_eau"
#> [9] "code_operation_prelevement" "code_prelevement"
#> [11] "code_qualification" "code_region"
#> [13] "code_sous_bassin" "code_station_hydrobio"
#> [15] "code_support" "date_debut_prelevement"
#> [17] "date_fin_prelevement" "distance"
#> [19] "fields" "format"
#> [21] "latitude" "libelle_indice"
#> [23] "longitude" "page"
#> [25] "resultat_indice_max" "resultat_indice_min"
#> [27] "size" "sort"
get_hydrobio_indices(code_commune = 35051)
#> # A tibble: 258 × 44
#> code_indice libelle_indice code_station_hydrobio libelle_station_hydr…¹
#> <chr> <chr> <chr> <chr>
#> 1 7644 Score de la métriqu… 04204300 VILAINE à CESSON-SEVI…
#> 2 7745 Score de la métriqu… 04204300 VILAINE à CESSON-SEVI…
#> 3 7746 Score de la métriqu… 04204300 VILAINE à CESSON-SEVI…
#> 4 7743 Score de la métriqu… 04204300 VILAINE à CESSON-SEVI…
#> 5 7036 Indice Poisson Rivi… 04204300 VILAINE à CESSON-SEVI…
#> 6 7744 Score de la métriqu… 04204300 VILAINE à CESSON-SEVI…
#> 7 7786 Score de la métriqu… 04204300 VILAINE à CESSON-SEVI…
#> 8 7787 Score de la métriqu… 04204300 VILAINE à CESSON-SEVI…
#> 9 8056 Métrique Polyvoltin… 04204300 VILAINE à CESSON-SEVI…
#> 10 8050 Nombre de taxons co… 04204300 VILAINE à CESSON-SEVI…
#> # ℹ 248 more rows
#> # ℹ abbreviated name: ¹libelle_station_hydrobio
#> # ℹ 40 more variables: uri_station_hydrobio <chr>, date_prelevement <chr>,
#> # resultat_indice <dbl>, unite_indice <chr>, coordonnee_x <dbl>,
#> # coordonnee_y <dbl>, code_projection <chr>, code_cours_eau <chr>,
#> # libelle_cours_eau <chr>, uri_cours_eau <chr>, code_masse_eau <chr>,
#> # libelle_masse_eau <chr>, uri_masse_eau <chr>, code_sous_bassin <chr>, …
# species records in the city of Rennes
list_params(api = "hydrobio",
endpoint = "taxons")
#> [1] "bbox" "code_appel_taxon"
#> [3] "code_banque_reference" "code_bassin"
#> [5] "code_commune" "code_cours_eau"
#> [7] "code_departement" "code_masse_eau"
#> [9] "code_operation_prelevement" "code_prelevement"
#> [11] "code_qualification" "code_region"
#> [13] "code_sous_bassin" "code_station_hydrobio"
#> [15] "code_support" "code_type_resultat"
#> [17] "codes_indices_operation" "date_debut_prelevement"
#> [19] "date_fin_prelevement" "distance"
#> [21] "fields" "format"
#> [23] "latitude" "longitude"
#> [25] "page" "size"
#> [27] "sort"
get_hydrobio_taxons(code_commune = 35051)
#> # A tibble: 13,151 × 90
#> code_station_hydrobio libelle_station_hydrobio uri_station_hydrobio
#> <chr> <chr> <chr>
#> 1 04204300 VILAINE à CESSON-SEVIGNE https://id.eaufrance.fr/Stati…
#> 2 04204300 VILAINE à CESSON-SEVIGNE https://id.eaufrance.fr/Stati…
#> 3 04204300 VILAINE à CESSON-SEVIGNE https://id.eaufrance.fr/Stati…
#> 4 04204300 VILAINE à CESSON-SEVIGNE https://id.eaufrance.fr/Stati…
#> 5 04204300 VILAINE à CESSON-SEVIGNE https://id.eaufrance.fr/Stati…
#> 6 04204300 VILAINE à CESSON-SEVIGNE https://id.eaufrance.fr/Stati…
#> 7 04204300 VILAINE à CESSON-SEVIGNE https://id.eaufrance.fr/Stati…
#> 8 04204300 VILAINE à CESSON-SEVIGNE https://id.eaufrance.fr/Stati…
#> 9 04204300 VILAINE à CESSON-SEVIGNE https://id.eaufrance.fr/Stati…
#> 10 04204300 VILAINE à CESSON-SEVIGNE https://id.eaufrance.fr/Stati…
#> # ℹ 13,141 more rows
#> # ℹ 87 more variables: date_prelevement <chr>, code_support <chr>,
#> # libelle_support <chr>, code_appel_taxon <chr>, libelle_appel_taxon <chr>,
#> # codes_taxons_parents1 <chr>, codes_taxons_parents2 <chr>,
#> # codes_taxons_parents3 <chr>, codes_taxons_parents4 <chr>,
#> # codes_taxons_parents5 <chr>, codes_taxons_parents6 <chr>,
#> # codes_taxons_parents7 <chr>, codes_taxons_parents8 <chr>, …
# }